정밀의료와 신약개발 연구의 분석 범위가 어떤 유전자가 발현되는지를 넘어 조직 안의 어느 위치에서 발현되는지를 확인하는 단계로 확장되고 있다. 같은 조직 안에서도 세포의 위치와 주변 세포와의 상호작용에 따라 질병에 미치는 영향이 달라질 수 있기 때문이다. 공간전사체 분석은 유전자 발현 데이터에 세포의 위치 정보를 결합해 암 미세환경과 질병 기전을 입체적으로 살펴보는 기술이다. 글로벌 AI 유전체 분석 기업 마크로젠이 10x지노믹스의 공간생물학 분석 플랫폼 ‘Atera’를 아시아 최초로 도입한다.
마크로젠은 오는 10일 오후 2시 온라인 웨비나를 열고 Atera의 주요 기능과 정밀의료·신약개발 연구 활용 방안을 소개한다. 같은 날부터 Atera 분석 서비스의 사전 예약 접수도 시작한다.
마크로젠이 9월 10일 공간생물학 분석 플랫폼 ‘Atera’의 주요 기능과 연구 활용 방안을 소개하는 온라인 웨비나를 개최한다. (자료 제공: 마크로젠)
마크로젠은 지난 6월 준공한 송도글로벌지놈센터를 중심으로 대규모 유전체 데이터 생산과 AI 기반 분석 인프라를 구축해 왔다. 이번 도입으로 기존 유전체와 싱글셀 분석에 조직 내 세포의 위치 정보를 다루는 공간전사체 분석을 추가한다.
1만8,000개 이상 유전자와 위치 정보 동시 분석
Atera는 세포의 공간적 위치와 함께 1만8,000개 이상의 전체 유전자 발현 데이터를 단일세포 수준으로 분석하는 플랫폼이다. 약 5,000개 유전자를 대상으로 하는 기존 타깃 패널 방식보다 많은 유전자를 분석해 조직 내 발현 양상과 공간적 분포를 함께 확인할 수 있다.
세포 내부의 하부 구조를 구분하는 해상도를 지원하며 신선동결 조직과 FFPE 시료를 모두 분석할 수 있다. FFPE는 조직을 파라핀에 보존하는 방식으로 병원과 연구기관에 축적된 시료 분석에 폭넓게 사용된다.
대용량 조직 분석을 위한 처리 기능도 갖췄다. 슬라이드 한 장에서 5㎠ 이상의 조직 부위를 분석하고, 한 번 가동할 때 대형 조직 슬라이드 최대 4장을 자동으로 처리한다. 제조사 기준으로 1㎠ 크기의 전체 전사체 시료를 연간 최대 800개 분석할 수 있어 대규모 환자군을 다루는 코호트 연구에 활용할 수 있다.
공간전사체 분석은 조직 안에서 암세포와 면역세포가 어떻게 분포하고 상호작용하는지를 확인하는 데 사용된다. 마크로젠은 Atera를 암 미세환경 분석과 면역항암제 반응성 예측, 희귀·난치성 질환의 병리 기전 규명, 신약 타깃 발굴 등의 연구에 적용할 계획이다.
이번 웨비나는 제약·바이오 기업과 병원·연구기관 관계자, 공간생물학 및 단일세포 분석 연구자를 대상으로 진행된다. Atera의 분석 방식과 처리 성능을 소개하고 연구 분야별 활용 사례를 공유할 예정이다.
마크로젠 관계자는 “Atera 도입으로 대규모 공간전사체 분석 역량을 확보하고 정밀의료와 신약개발 연구를 지원할 데이터 기반을 강화했다”며 “송도글로벌지놈센터를 중심으로 유전체·싱글셀·공간전사체와 AI 데이터 분석을 연결해 질병 기전 규명과 신약 타깃 발굴을 지원하겠다”고 말했다.
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